Vincent Bourret

Docteur Vétérinaire, lauréat de l'Université de Toulouse

Docteur en Virologie de l'Université de Cambridge (R.-U.)

Post-doctorant de l’Université de Montpellier au Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE, UMR 5175)

Adresse :

CEFE

1919 route de Mende (campus CNRS)
34293 Montpellier 5
France

Téléphone :          +33 (0)4 67 61 32 96

Courriel :              vincent.bourret[arobase]cefe.cnrs.fr

Intérêts professionnels :

Outre l’enseignement, je m’intéresse principalement à la faune sauvage, notamment aquatique. J'ai participé à des projets touchant à l'interaction entre faune sauvage et activités humaines, ainsi que des projets d'étude plus fondamentaux. En voici les principaux:

- Interactions pêche-cétacés : participation à une étude des risques présentés par une pêche thonière (filets pélagiques) pour les petits cétacés en Méditerranée nord-ouest en tant qu'observateur scientifique en haute mer

Cadre: Centre d’Océanologie de Marseille (CNRS), avec Guy Imbert

- Génétique des populations de cétacés : étude expérimentale de la structure génétique des populations de dauphins bleu-et-blanc (Stenella cœruleoalba) en Méditerranée occidentale et zone Atlantique adjacente. Réalisation d'une revue de l’utilisation de marqueurs microsatellites chez les cétacés

Cadre: UMR 5174 CNRS/UPS de Toulouse - resp. scientifique Brigitte Crouau-Roy; en collaboration avec l’«Area de Biología animal» de la Faculté vétérinaire de Murcie, Espagne

- Reproduction chez les oiseaux marins : observations de terrain en écologie comportementale de la mouette tridactyle (Rissa tridactyla) sur l’île de Middleton, Alaska (59°26 N 146°20 O)

Cadre: UMR CNRS/UPS 5174 «Evolution et Diversité biologique» de Toulouse ; en collaboration avec l’US Geological Survey, Alaska Science Center.

Egalement, étude de pétrels bleus sur l’archipel de Kerguelen (Terres Australes et Antarctiques Françaises) avec le CEFE

- Mammifères aquatiques en Amazonie : participation à un inventaire préliminaire de la faune et flore sur une concession pour la conservation dans la région du Loreto, Pérou (6°10 S 74°44 O)

Cadre: ONG Conservaciὀn Amazὀnica

- Vaccination contre le choléra aviaire à Pasteurella multocida chez les populations d’albatros de la Nouvelle-Amsterdam (Océan Indien) : étude de la transmission de bactéries pathogènes au sein de populations d’albatros à bec jaune en déclin, rôle d’autres espèces dans les cycles épidémiologiques, et efficacité d’un autovaccin développé en partenariat avec BIOVAC administré sur le terrain à des adultes et des poussins

Cadre: CEFE—CNRS, équipe Ecologie spatiale des populations

- Adaptation inter-specifique et évolution des virus influenza : de la faune sauvage aux espèces domestiques et l’homme.

· Etude expérimentale de l’adaptation inter-spécifique d'un virus influenza A depuis le canard ("réservoir" sauvage pour ces virus) vers le porc (hôte intermédiaire pour l’adaptation à l’homme). Ce projet consiste en (i) l’adaptation d’une souche de grippe aviaire à une croissance accélérée en cellules de trachée de porc, (ii) l’identification de facteurs moléculaires viraux impliqués dans ce processus, (iii) une étude phylogénétique poussée de l’émergence de mutations adaptatives réalisée avec Simon Frost de Université de Cambridge.

Département de Médecine Vétérinaire de l’Université de Cambridge (Laurence Tiley) ; en collaboration avec l'Unité de maladies contagieuses de l’ENVT

· Diversité virale intra-hôte chez des patients humains atteints par la souche pandémique 2009.

Unité de maladies contagieuses de l’ENVT ; en collaboration avec le Laboratoire de Virologie, CHU Purpan

· Récepteurs et sauts d’espèce (en cours) : méta-analyses de la préférence des virus influenza pour différents types de récepteurs, distribution de ces récepteurs chez les différents hôtes et hypothèses évolutives (avec Sylvain Gandon).

Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (UMR 5175) ; en collaboration avec le Département de Médecine Vétérinaire de l’Université de Cambridge et l'Unité de maladies contagieuses de l’ENVT

Enseignement :

Théorique (avec S. Bertagnoli, 2011-2014) :

Bactériologie médicale – A2 ENVT

Vaccins Influenza humains - M2 Pro Vaccinologie

Orthomyxoviridӕ - A2 ENVT

Pratique :

TP d'immunologie – A2 ENVT (avec S. Boullier)

TD de maladies infectieuses et Anglais – A2 ENVT (avec S. Bertagnoli, F. Michaud et B. Séverac)

Participation à l’encadrement d’une thèse d’exercice vétérinaire sur la captivité des dauphins pdf

Encadrement de stagiaires en laboratoire pour des projets de plusieurs mois (élèves de médecine vétérinaire et humaine) – Université de Cambridge

Documents :

Thèses :

« Microsatellites en génétique des cétacés: application à l’étude des populations de dauphins bleu-et-blanc (Stenella cœruleoalba) de Méditerranée occidentale et de la zone atlantique proche » pdf

par Vincent Bourret

Thèse d'exercice : médecine vétérinaire ; Toulouse : 2006 - TOU 3 – 4092.

« Genetic adaptation of an avian influenza A virus to swine cells »

Par Vincent Bourret

Doctorate of Philosophy thesis (155 pp). University of Cambridge, 2012.

Articles :

« Blue petrels recognize the odor of their egg » lien pdf

par Sarah Leclaire, Vincent Bourret et Francesco Bonadonna

paru dans Journal of Experimental Biology, 2017, 220 : 3022-3025

« Adaptation of avian influenza virus to a swine host » lien

par Vincent Bourret, Jon Lyall, Simon D. W. Frost, Angélique Teillaud, Catherine A. Smith, Sarah Leclaire, JinQi Fu, Sylvain Gandon, Jean-Luc Guérin et Laurence S. Tiley

paru dans Virus Evolution, 2017, 3 : vex007.

« Migration, prospecting, dispersal? What host movement matters for infectious agent circulation? » lien

par Thierry Boulinier, Sarah Kada, Aurore Ponchon, Marlène Dupraz, Muriel Dietrich, Amandine Gamble, Vincent Bourret, Olivier Duriez, Romain Bazire, Jérémy Tornos, Torkild Tveraa, Thierry Chambert, Romain Garnier et Karen McCoy.

paru dans Integrative and Comparative Biology, 2016, 56 : 330–342.

« Carotenoids increase immunity and sex-specifically affect color and redox homeostasis in a monochromatic seabird » lien

par Sarah Leclaire, Vincent Bourret, Pierrick Blanchard, Christophe de Franceschi, Thomas Merkling, Scott A. Hatch et Etienne Danchin

paru dans Behavioral Ecology and Sociobiology, 2015, 69 : 1097-1111.

« Intra-host viral variability in children clinically infected with H1N1 (2009) pandemic influenza » lien

par Vincent Bourret, Guillaume Croville, Jean-Michel Mansuy, Catherine Mengelle, Jérôme Mariette, Christophe Klopp, Clémence Genthon, Jacques Izopet et Jean-Luc Guérin

paru dans Infection, Genetics and Evolution, 2015, 33 : 47-54.

« Whole-genome, deep pyrosequencing analysis of a duck influenza virus evolution in swine cells » pdf SOM

par Vincent Bourret, Guillaume Croville, Jérôme Mariette, Christophe Klopp, Olivier Bouchez, Laurence Tiley et Jean-Luc Guérin

paru dans Infection, Genetics and Evolution, 2013, 18 : 31-41.

« Development of an improved polykaryon-based influenza virus rescue system » lien

par Vincent Bourret, Jon Lyall, Mariette F. Ducatez, Jean-Luc Guérin et Laurence Tiley

paru dans BMC Biotechnology, 2012, 12 : 69.

« Behavioral and physiological responses to male handicap in chick-rearing Black-legged kittiwakes » pdf

par Sarah Leclaire, Vincent Bourret, Richard H. Wagner, Scott A. Hatch, Fabrice Helfenstein, Olivier Chastel et Etienne Danchin

paru dans Behavioural Ecology, 2011, 22 : 1156-65.

« Microsatellites in cetaceans: an overview » pdf SOM

par Vincent Bourret, Matthias Macé, Maxime Bonhomme et Brigitte Crouau-Roy

paru dans The Open Marine Biology Journal, 2008, 2 : 38-42.

« Genetic variation and population structure of western Mediterranean and northern Atlantic Stenella cœruleoalba populations inferred from microsatellite data » pdf

par Vincent Bourret, Matthias Macé et Brigitte Crouau-Roy

paru dans Journal of the Marine Biological Association of the U.K., 2007, 87 : 265-9.

Autres rapports :

« Informe sobre la salida de Octubre 2007 en la Concesión para la conservación de los ríos Yanayacu y Maquía » pdf

par Miguel Chocce, Nelson Gutiérrez, Margarita Medina, Vincent Bourret, Sarah Leclaire et Jean Olivier

         2008.

« Première approche vétérinaire des risques associés à l’accueil dans le canal du Rove de Grands dauphins issus de captivité » pdf

par Vincent Bourret, Céline Lambert et Emmanuel Liénard

         Actes de la journée « Delphinorove » du 9 avril 2014 (J.-C. Cheinet et C. Hily, éditeurs)